手机操作系统按是否开源可分为开放式系统和封闭式系统两类。开放式系统以Android为代表，封闭式系统以苹果IOS为代表。不论是哪一种操作系统都有一定的阻力因素影响手机操作系统市场发展。
开放式系统版本混乱，稳定性差
作为开放式系统的典型代表，Android通过开源获得了众多商家的支持，但是也由此带来了很多问题。目前全球约有30多家手机厂商和操作系统提供商，向市场推出250多款Android手机，发布了100多款Android的产品发行版，Android版本过多，没有统一的标准。
与此同时，Android版本的升级过快给开发者带来巨大压力。随着Android版本的升级，其SDK版本也在不断更新。不同SDK版本的Android应用程序在开发上存在着一定的不同，如果在这些应用没有完全成熟之前新的SDK版本就出来的话，开发者就要不停止地追逐下去，带来相当大的压力。
封闭系统，缺乏商家支持
苹果iPhone是封闭系统的典型代表。尽管iPhone的封闭性让它拥有其他商家难以企及的高利润率，也在一定程度上解决了流氓软件、用户信息盗取和盗版等问题。但是我们也不能忽略由于封闭带来的问题。
长久的封闭会导致“同质化”严重。尽管现在，苹果iPhone运用其独特的设计及非凡的用户体验受到了广大用户的青睐，但是若长期固闭自封，难免“同质化”出现，最终导致审美疲劳，重蹈Symbian的覆辙。此外，封闭的系统对企业在研发和维护上投入要求很高。
智能手机智能性尚待完善
无论是开放式手机操作系统，还是封闭式手机操作系统，他们带来的智能手机终究还是手机。在性能上，尽管智能手机拥有强大的功能扩展性，但可能受手机屏幕大小的影响、或者手机电池电量的影响、手机输入方式的影响等，始终无法与真正的PC相媲美。例如，玩游戏没有PC电脑屏幕带来的视觉感，聊天看电影还要考虑电池电量，处理文件不如PC方便。
